3730XL DNA Analyzer开放时间:
一. 开学期间:
A) 正常工作时间段:周一至周五,时段:8:00-18:00,接收待测序样品;
B) 非正常工作时间段:周一至周五,时段:18:00-次日8:00,周六至周日及学校法定节假日全天,测序样品请投入仪器中心127房间外样品箱中。
二. 寒暑假期间:
A)正常工作时间段:周一至周五,时段:9:00-17:00,接收待测序样品;
B) 非正常工作时间段:周一至周五,时段:17:00-次日9:00,周六至周日全天,待测序样品请投入仪器中心127房间外样品箱中。
样品递交说明:
一. 样品信息单
用户需详细填写“测序登记表”,所有样品需随同“测序登记表”一起递交。若样品数较多,可以递交电子版本,您只需在送样前将填写完整的excel表格发送至microimage@pku.edu.cn即可。
二. 送样要求:
1)菌液:
请提供1.2mL左右的新鲜菌液装在1.5mL的离心管中并封好,我们会直接进行质粒提取。
2)质粒:
要求样品稀释浓度至50-100 ng/uL, 提供10uL以上。OD260/OD280=1.6-2.0, OD260/OD230=1.6-2.0;
3)PCR产物:请随样品提供电泳胶图,确定PCR产物为单一扩增条带。
若提供已纯化好的PCR产物,条带必须单一,OD260/OD280=1.6-2.0, 最好溶解在已灭菌的去离子水中。浓度要求>10ng/uL,提供10uL以上。
4)RCA样品:请随样品提供电泳胶图。用无菌水稀释3倍。
5)自带引物必须用水稀释至1uM。
三.测序引物要求:
测序质量,测序用引物的要求较高,引物的3’端必须与模板完全匹配。
用于测序的引物一定要经过PAGE纯化,纯度应>90%,溶解在已灭菌的去离子
水中。此外,测序引物长度最好在17-24bp,GC含量在50-60%左右。请一定在
测序单上详细填写好提供引物的浓度。
测序周期:
一. 最佳收样时间:8:00-11:00,当日即可获得测序结果;
二. 若11:00之后送样,第二天获得测序结果;
三. 菌液和PCR未纯化样品,执行周期最迟约48小时后发送测序结果;
四. 若有加急样品,与仪器中心老师沟通约定。
测序结果:
一. 正常情况下,3730XL DNA Analyzer至少保证800bp的有效测序长度。测序完成后,我们会对每个样品提供一份测序报告,其中包括:测出的序列彩峰图和序列文件;
二. 在进行DNA测序时,紧邻引物的20-40bp测序准确性偏低;
三. 出现DNA模板上的特殊结构,比如:G/C rich; Poly A/T/C/G连续结构等,将会出现测序反应中断无法进行测序的情况;另外,若DNA模板结构中的重复序列,致使测序引物和模板之间有两个有2个以上的结合位点,将会产生反应中途出现套峰现象。类似以上情况由于DNA结构原因造成无法正常进行DNA测序,我们会根据具体测序结果进行相应收费。
四. 对测序结果不好的样品,我们会及时跟相关的老师同学沟通,尽力找到可能的原因,改善实验操作。
样品后期保存:
测序结束后会,我们保存相关样品3天。若有返还样品要求,请及时与我们联系。电话:010-62768301 董老师 李老师